物理消泡器的工作原理是讓泡沫進入到轉子工作區，通過高速轉子提供的剪切力撕碎氣泡，讓氣泡和液體分離，氣泡釋放出的液體立即被離心力摔向器壁，并壓縮為液流，一部分回流到池中，另一部分通過器壁的多孔結構回流渦殼收集器中，由管道返回池中。

物理消泡器主要應用在食品生產泡沫、線路板生產泡沫、切割液泡沫、水性漆泡沫等生產領域。相比于化學消泡，物理消泡不會產生二次污染，因為化學消泡采用的消泡劑絕大數都含有硅，會損害生產設備。并且化學液體的污水處理也需要投入一些成本。另外物理消泡器可以避免消泡劑的重復大量購買的成本，基本一臺物理消泡器就是一次消費。

物理消泡器主要是解決液體氣泡問題，很多企業都在使用物理除泡法代替化學藥劑除泡。